1、外观不同。云吞因各地做法不同，形状各异且外皮很薄。而小馄饨在外形上看形似一个小“金元宝”，外皮更厚一些。
2、制作的馅料不同。小馄饨的馅料主要是肉、菜和糖等原料制作而成，云吞的馅料不仅可以用猪肉和菜作为原料，还可以佐以马蹄、香菇、虾仁等食材，口感更加丰富。
3、产地不同。云吞是馄饨的改良产品，起源于两广一带，是当地的特色小吃。而馄饨起源于北方地区，是汉族传统美食，历史更为悠久。
